【BI技術者認定試験対策】サイズで見分ける！「ノンコーディングRNAの分類」を攻略
タンパク質に翻訳されないノンコーディングRNA（ncRNA）。その種類は膨大ですが、まずは「長さ（サイズ）」によって2つのグループに大別する基本ルールを押さえましょう。
1. 問題：ncRNAの長さによる分類
【 問題 】 ノンコーディングRNA（ncRNA）は、その塩基長の長さによって「短鎖ノンコーディングRNA」と「長鎖ノンコーディングRNA（lncRNA）」の2つに大きく分類されます。この分類の境界（閾値）となる一般的な長さとして、最も適切なものはどれでしょうか？
① 20 塩基 ② 200 塩基 ③ 2,000 塩基 ④ 20,000 塩基
2. 正解：RNAのデータサイズに関する正解
正解： ② 200 塩基
3. 解説：200文字（塩基）を境界とするルール
ncRNAをサイズで分けるときの国際的な標準ルールが「200塩基（nucleotides：nt）」です。ITの文字数制限のように、この数字を境に呼び名と性質が変わります。
★ 短鎖ノンコーディングRNA（Small ncRNA）：
・長さ：200塩基未満（実際によく狙われるmiRNAやsiRNAは20〜30塩基程度）。
・主な役割：特定のmRNAに貼り付いて、ピンポイントで翻訳をジャミング（抑制）する。
★ 長鎖ノンコーディングRNA（lncRNA：Long non-coding RNA）：
・長さ：200塩基以上（数千〜数万塩基に及ぶものもあります）。
・主な役割：複雑に折りたたまれて立体構造を作り、ヒストンやDNAに直接作用して、ゲノムの広い領域のスイッチを一括で切り替える。
1. 試験のポイント: 試験では「長さによって短鎖と長鎖（lncRNA）に分類される」という概念そのものに加え、選択肢にある「200塩基」という具体的な閾値がピンポイントで問われることがあります。桁数の引っかけに騙されないよう、数字を頭に叩き込んでおきましょう。
2. バイオインフォの視点: 次世代シークエンサー（RNA-Seq）でRNAの量を計測する際、実験の準備段階（ライブラリ調製）で「200塩基より長いものだけを集める」「短いものだけを抽出する」といったサイズセレクション（フィルタリング）を物理的に行います。そのため、手元のデータが「短鎖RNAデータ（Small RNA-Seq）」なのか「全RNAデータ（Total RNA-Seq）」なのかによって、マッピングに使うリファレンス配列やアライメントツール（STARやBowtie2など）のパラメータ設定を最適化する必要があります。
4. まとめ
「ncRNAは長さに注目すると、短鎖（200塩基未満）と長鎖（200塩基以上）に分類される」です。前の問題で登場した『miRNAは短鎖』、『クロマチン構造を変えるlncRNAは長鎖』という関係性も、このサイズの定義を知ることでより立体的に理解できますね！
