【BI技術者認定試験対策】ゲノム上の住所!「遺伝子座」を攻略
染色体という巨大なストレージの中で、特定の遺伝子が「どの位置に格納されているか」を表すバイオの基本用語をマスターしましょう。
1. 問題:遺伝子が染色体上に占める位置
【 問題 】 特定の遺伝子(または特定の塩基配列)が、染色体上に占める固有の位置(ゲノム上の住所・アドレス)を何と呼ぶでしょうか?
① 遺伝子座(ロカス) ② セントロメア ③ プロモーター ④ 対立遺伝子
2. 正解:ゲノム構造と位置指定に関する正解
正解: ① 遺伝子座( locus:ローカス / 複数形 loci:ローサイ)
3. 解説:染色体のアドレス表現
ヒトは父親と母親から同じ遺伝子座を持つ染色体を1本ずつ引き継ぐため、通常は各遺伝子座を「対(ペア)」で保持しています。
★ 遺伝子座(Locus):染色体上の「場所(住所・スロット)」のこと。
★ 対立遺伝子(Allele):その遺伝子座(スロット)にセットされている「具体的に異なるバリエーション(データ内容)」のこと。例:血液型遺伝子座(場所)に入る「A型・B型・O型」の遺伝子(内容)。
1. 試験のポイント: 「遺伝子の染色体上に占める位置」というキーワードが出たら、迷わず「遺伝子座」を選びます。英語表記の `locus`(ローカス)というカタカナ表記で問われることもあるため、両方の名称を押さえておきましょう。
2. バイオインフォの視点: ゲノムデータ処理において、遺伝子座は `chr1:12345678-12346000` のように「染色体番号+開始位置(Start)+終了位置(End)」という絶対座標(1-based または 0-based coordinate system)で扱われます。BEDファイルやGFF/GTFファイルといったアノテーションデータは、この遺伝子座(ゲノム座標)を標準フォーマットとして管理・検索するために使われています。
4. まとめ
「遺伝子が染色体上に占める位置=遺伝子座(locus)」です。システムで言えば、メモリアドレスやデータベースのキー(主キーの検索パス)に該当するものであり、ゲノム解析を行う上での全てのデータ参照の基準となる非常に重要な概念ですね!