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バイオインフォマティックス技術者試験、情報処理試験など、IT系の試験を基礎から勉強します。また、Javaなどプログラミングを勉強します。

【BI技術者認定試験対策】読み取りの枠組み!「フレーム」を攻略

DNAやRNAの塩基配列は、どこから3文字ずつ区切って読むかによって、得られる情報が全く変わってしまいます。この「読み取りの枠組み」について学びましょう。

1. 問題:塩基配列の区切り方

【 問題 】 DNAやRNAの塩基配列において、連続した塩基を3つずつのまとまりとして区切る読み取りの枠組みを何と呼ぶでしょうか?

① イントロン   ② フレーム(読取枠)   ③ プロモーター   ④ オペロン

2. 正解:遺伝暗号の読み方に関する正解

正解: ② フレーム(読取枠)

3. 解説:1文字ズレるだけで大違い

塩基配列は「3文字1組」でアミノ酸を指定しますが、その「区切り出し地点」が重要です。

[ フレーム(読み取り枠)の特徴 ]
3種類の可能性:1つの塩基配列に対して、開始位置を1文字ずつずらすことで、計3通りの「フレーム」が存在することになります。
オープンリーディングフレーム(ORF):開始コドンから終止コドンまで、途切れることなくアミノ酸を指定し続けられる長いフレームのことを指します。ここが実際の遺伝子である可能性が高い場所です。
フレームシフト:塩基が1つ挿入されたり欠失したりすることで、この区切りがずれてしまうことを「フレームシフト突然変異」と呼びます。

1. 試験のポイント: 「コドン」は3つの塩基の具体的な配列を指しますが、その3つずつの「区切り方そのもの」を指す場合は「フレーム(リーディングフレーム)」という言葉が使われます。特にフレームシフトがタンパク質の構造に致命的な影響を与える点は頻出です。
2. バイオインフォの視点: 未知のゲノム配列から遺伝子を探し出す際、コンピューターは6通り(相補鎖を含めて3つずつ)のフレームすべてをスキャンして、長いORFを探します。この「遺伝子予測(Gene Prediction)」は、アノテーション作業における最も基本的なステップです。


4. まとめ

「3つずつの読み取りの枠=フレーム」です。どこから読み始めるかで、翻訳されるタンパク質の内容がガラリと変わるという繊細な仕組みを理解しておきましょう!

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