忍者ブログ
バイオインフォマティックス技術者試験、情報処理試験など、IT系の試験を基礎から勉強します。また、Javaなどプログラミングを勉強します。

【BI技術者認定試験対策】ゲノムの多様な制御者!「非コードRNA(ncRNA)」を攻略

mRNAのようにタンパク質へと翻訳(コード)されず、RNA分子そのものが機能を持って生体内の様々な制御を担う非コードRNA(ncRNA)について整理しましょう。

1. 問題:タンパク質をコードしないRNAの総称

【 問題 】 ゲノムDNAから転写されるものの、タンパク質への翻訳(コード)を行わず、RNA分子そのものが構造体や遺伝子発現制御などの機能を持つRNAの総称を何と呼ぶでしょうか?

① 非コードRNA(ncRNA)   ② 伝令RNA(mRNA)   ③ ゲノムRNA   ④ ペプチドRNA

2. 正解:RNAの種類と分類に関する正解

正解: ① 非コードRNA(ncRNA / non-coding RNA)

3. 解説:ncRNAの種類と広範な役割

ヒトゲノムの大部分(約70〜80%)はRNAへと転写されますが、タンパク質をコードするmRNA領域はゲノム全体の約1〜2%に過ぎません。残りの多くは非コードRNA(ncRNA)として多様な役割を果たしています。

[ 非コードRNA(ncRNA)の主な分類 ]
ハウスキーピングncRNA(インフラ型)
  ・tRNA(転移RNA):アミノ酸の運搬。
  ・rRNA(リボソームRNA):タンパク質合成(翻訳)の場を形成。
  ・snRNA(核内小形RNA):スプライシングに関与。
調節性ncRNA(制御型)
  ・小分子ncRNA(200塩基未満):miRNA(転写後抑制)、siRNA(RNA干渉)など。
  ・長鎖ncRNA(200塩基以上):lncRNA(クロマチン構造やエピジェネティクス制御)。

1. 試験のポイント: 「タンパク質をコードしないRNA=非コードRNA(ncRNA)」という定義をしっかり押さえましょう。試験では「ncRNAにはtRNAやrRNAのような古典的RNAから、miRNAやlncRNAといった調節性RNAまで幅広く含まれる」という分類問題が出題されます。
2. バイオインフォの視点: RNA-Seqデータ解析において、新規の転写産物がmRNAかncRNAかを判定するために、オープンリーディングフレーム(ORF)の長さ、アミノ酸組成の偏り、種間でのタンパク質ドメイン保存性を評価する計算ツール(`CPC2` や `CPAT` など)が使用されます。


4. まとめ

「タンパク質をコードしないRNA=非コードRNA(ncRNA)」です。システム開発で言えば、直接実行ファイルを生成するソースコード(mRNA)ではなく、システムの構成・ビルド条件・実行権限を動的にコントロールする「設定ファイルや環境制御スクリプト」のような役割ですね!


PR