忍者ブログ
バイオインフォマティックス技術者試験、情報処理試験など、IT系の試験を基礎から勉強します。また、Javaなどプログラミングを勉強します。

【BI技術者認定試験対策】ゲノム編集の案内役!「crRNA」を攻略

ノーベル賞を受賞したゲノム編集技術「CRISPR/Cas9」。ハサミ役である酵素(Cas9)を、狙ったDNA配列へと正確に案内するナビゲーター「crRNA」の役割をマスターしましょう。

1. 問題:標的DNAを認識するRNA

【 問題 】 CRISPR/Cas9システムにおいて、CRISPR領域から転写されて作られ、標的となる対象DNAの塩基配列と相補的に結合することで、Cas9酵素を目的の場所へと誘導する役割を持つRNAは何でしょうか?

① mRNA   ② crRNA(CRISPR RNA)   ③ tracrRNA   ④ gRNA(ガイドRNA)

2. 正解:ゲノム編集の構成要素に関する正解

正解: ② crRNA(CRISPR RNA)

3. 解説:ハサミを誘導する「指名手配書」

もともとこの仕組みは、細菌が過去に感染したウイルスの断片(DNA)を自分のゲノム(CRISPR配列)に記憶し、再感染時にそれをRNAとしてコピーして敵を撃退する「獲得免疫システム」に由来しています。

[ CRISPR/Cas9を構成するRNAたち ]
crRNA(CRISPR RNA):今回の主役。標的DNAとぴったり結合する「指名手配の顔写真(配列)」にあたる部分です。
tracrRNA(トランス活性化型CRISPR RNA):ハサミ(Cas9酵素)とcrRNAをがっちり繋ぎ止めるための「ホルダー(土台)」の役割をするRNAです。
sgRNA / gRNA(シングルガイドRNA):研究やゲノム編集をやりやすくするため、本来バラバラだった「crRNA + tracrRNA」を人工的に1本に連結したものです。

1. 試験のポイント: 「対象DNAに対応する(相補的な)配列を持つ」という、ターゲット特異的な部分を指す場合は「crRNA」が正解です。一方で、「crRNAとtracrRNAを1本にまとめた人工RNA」という文脈であれば「gRNA(ガイドRNA)」が正解になります。問題文の細かいニュアンスを読み分けましょう。
2. バイオインフォの視点: ゲノム編集を設計する際、crRNAの配列(約20塩基)をどうデザインするかが極めて重要です。ゲノム上の目的の場所だけに結合し、似たような別の場所(オフターゲット領域)を誤って切断しないよう、全ゲノム配列を対象に高速に文字列検索(ブラストやマッピングアルゴリズム)を行い、最適なcrRNA配列候補を算出するソフトウェアの開発は、バイオインフォマティクスの中心的なテーマの一つです。


4. まとめ

「標的DNAをピンポイントで見つけ出すナビゲーター=crRNA」です。これがあるおかげで、30億塩基もある膨大なゲノムデータの中から、たった1箇所のピンポイントなバグ(狙った配列)を見つけ出して書き換えることができるのですね!


PR